3號線目前主要有3種行車交路以及少量區間車。其中，機場北－體育西路及番禺廣場－天河客運站交路爲全日行駛，機場北－番禺廣場交路主要於大約上午09時至晚間21時開行。
| 行車交路 (起點、分岔點及終點) | 顯示/隱藏乘車指引 | ||
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機場北 Airport North 330北延段 | 體育西路 Tiyu Xilu 311 | ||
機場北 Airport North 330北延段 | 體育西路 Tiyu Xilu 311主線 | 番禺廣場 Panyu Square 301 | |
天河客運站 Tianhe Coach Terminal 316支線 | 體育西路 Tiyu Xilu 311主線 | 番禺廣場 Panyu Square 301 | |
| 上車前請留意站台電視及廣播，上車後請留意車門上方閃燈路線圖或走字屏顯示及車廂廣播 | |||
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