廣州交局官網消息，2019年05月26日首班車起，以下路綫變動將會生效：
1、64增加停靠南漖村、玉蘭路中、玉蘭路南、東西路站；
2、64A暫停營運；
3、409受河水東大街市政工程影響，臨時暫停營運；
4、792總站改爲南湖半島花園總站，取消停靠老莊、新莊總站，往南湖半島花園總站方向取消停靠南湖半山站，首尾班車時間改爲：06:40~20:00，發班間隔改爲：07:00~09:00及17:00~18:00期間不大於15分鐘一班，其他時段每30分鐘一班（逢整點、半點發班）；
5、792A總站改爲沙太貨運站總站，取消停靠南湖半島花園總站，增加停靠老莊、林科所、黃莊站，往沙太貨運站總站方向增加停靠南湖半山站；
6、科學城專綫3取消行走南翔一路、科豐路、天豐路、天泰二路及開泰大道，改爲過南雲三路口後行走南翔二路、科珠路、科學大道、映日路轉回科學大道後按原綫。
| 路綫 | 起始站 | 路綫圖 | 首尾班車時間 |
|---|---|---|---|
| 科學城專綫3 | 蘿崗中心區總站 | 蘿崗中心區總站→演藝中心北門→地鐵蘿崗站→開創大道(香雪山南)→開創大道(中大嶺南醫院)→地鐵蘇元站(暹崗聖賢)→地鐵暹崗站→映日路東→映日路中(翡翠皇冠假日酒店)→映日路西→科學信息大廈→廣東軟件園→玉樹新村→南翔二路→南雲三路口→南雲三路中→科林路中→科珠路口→科珠路南→南雲一路南→南雲一路中→玉樹大街口→廣東國防教育基地總站 | 06:30~21:00 |
| 廣東國防教育基地總站 | 廣東國防教育基地總站→玉樹大街口→南雲一路中→南雲一路南→科珠路南→科珠路口→科林路中→南雲三路中→南雲三路口→南翔二路→玉樹新村→廣東軟件園→科學信息大廈→映日路西→映日路中(翡翠皇冠假日酒店)→映日路東→地鐵暹崗站→地鐵蘇元站(暹崗聖賢)→開創大道(中大嶺南醫院)→開創大道(香雪山南)→地鐵蘿崗站→演藝中心北門→蘿崗中心區總站 | 07:30~21:00 | |
| 07:00~09:00及17:00~19:00期間不大於15分鐘一班，其他時段不大於20分鐘一班。 | |||