广州交局官网消息，2019年09月28日首班车起，以下路线变动将会生效：
1、45、90、583、779、旅游3增加停靠新设于双塔路站（南行）对向港湾站台处的双塔路站（北行），原双塔路站（北行）更名为芳园路口站；
2、405增加停靠新设于五山路罗浮山路路口南侧约50米处的五山路(广园快速路)站（北行）；
3、582、582班车、776、901、901A、901A区间、902、高峰快线82、夜101改为停靠新设于岑村红花岗站（北行）以北50米增设的2号分站；
4、704、高速专线2双向增加停靠新设于方华公路东西门街路口的方华公路(方坑)站；
6、夜106双向增加停靠飞粤大道中(九一村)站；
7、植物园正门站（南行）往北迁移100米，涉及路线：B12、28、30、39、83、84、84A、345、345A、346、494、494A、534、535、564、775、高峰快线54、高峰快线64、夜10、夜71、夜100。